上海飞美娜多？
首先，你这个问题提得就有问题。 你应该问：「为什么上海没有飞往密克罗尼西亚的航班」而不是什么「上海飞美属琉球（即密克罗尼西亚）这么难」。 因为决定一条航线是否开通的因素有很多，不是某一个两个的因素就能够决定的。 比如说要开通一条新的国际航线，一个最基本的条件就是要有一个国家愿意接受这条新航线的开通。
以上海为例，假如美国想要开通一条旧金山-上海的直航，那么就必须先得到中国的认可（毕竟是从外国境内飞越）。然后还要经过一系列复杂的审批流程最终才能成行。 但问题是，中国并不希望美国开通太多往返中国的直航路线——中美之间本来就隔了一个太平洋，如今又隔着一山（珠穆朗玛峰），一旦有了直航，美国势必会加大对中国的渗透力度，这对于始终将美国视作「假想敌」的中国来说是无法接受的。所以虽然中国不会主动拒绝美国直航的申请，但也绝对不会主动批准美国的直航申请。只有当中国的外事部门发现美国直航的申请确实难以拒绝时才会批准。
对于中国政府的态度而言，其实并没有所谓的「难度系数」的问题，只有「该不该给」以及「能不能给」的问题。比如之前美国提出要在对台军售中卖给台湾F35战机，中国政府就立刻表示强烈抗议，并在短时间内使美国的打算无法成真。至于原因嘛……当然是中国不希望台湾问题进一步复杂化，不想让局势朝着更严重的方向发展。
回到本题本身，为什么上海到密克罗尼西亚没有直达航班呢？原因也是一样的。 中国政府从来都不是一家「讲理」的政府，而是秉承着「以势压人」、「以力服人」的原则在外交问题上发声的。在可以凭借实力说话的领域里，中国是绝对不会任人欺负的。所以你看，当美国想在关岛部署萨德反导系统时，虽然中国并不拥有关岛周边海域的海域使用权，也没有在关岛附近建设军事基地的权利，但中国还是派出军舰去抗议了；当法国宣布要重购导弹预警卫星时，虽然中国也知道此举会对北斗造成干扰，但出于维护本国核心利益考虑，中国依旧在表态上表示了强烈反对。
所以说，只要中国还是这个世界上唯一拥有核武器的国家，只要美国还在努力研制新一代激光核弹，两国之间的外交关系就不会有根本性的改变。上海至美属琉球的航班也就不太可能会有。